如果在厕所通风管道里发现了蝙蝠，第一时间要注意不要惊扰它们，因为蝙蝠是很敏感的动物，容易遭受惊吓，并且可能会攻击人。
然后，可以采取以下措施来处理：
1. 将通风管道封住：如果蝙蝠是在通风管道中，我们可以将通风管道封住，防止蝙蝠进入。如果蝙蝠已经从通风口进入了厕所，可以先将厕所门关上，然后尽可能避免声响，打开厕所有向外的窗户，等待蝙蝠自动离开。
2. 驱赶蝙蝠： 您可以在厕所里点燃一些香或放些薰香，这样可能会把蝙蝠引出厕所；或者您可以关掉厕所的灯和水龙头，然后张开门窗，营造一个蝙蝠不喜欢的环境，让蝙蝠寻找其他的途径离开。
3. 寻求专业帮助：如果您无法解决问题，或者您不知道如何处理蝙蝠，建议您联系当地的动物救援机构或野生动物保护协会，寻求专业帮助。
4. 预防措施：实行定期检查、清洁通风管道的工作，可以从根本上降低蝙蝠进入通风管道中的概率。您可以在通风口上安装防蝙蝠网，同时注意不要让厕所里留下食物残渣，因为这可能会吸引蝙蝠进入。
